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新型コロナ感染症関連データページ

更新 2020-05-11 (月) 06:55:25

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新型コロナウイルス 一般情報

コロナウイルス

文献 *1 

SARS-CoV-2の分類学上位置づけ

COVID-19(疾患名)の原因ウイルスである重症急性呼吸器症候群(SARS)コロナウイルス2型(SARS-CoV-2)の分類学上の位置づけ*2

SARS-CoV-2はRNAに遺伝情報をコードするRNAウイルスで,コロナウイルス科(Family Coronaviridae)に分類される.

コロナウイルス科はさまざまなウイルス種(species)が含まれる比較的大きな科である.コロナウイルス科は,レトウイルス亜科(Letovirinae)およびオルソコロナウイルス亜科(Orthocoronavirinae)に大きく分かれ,SARS-CoV-2はオルソコロナウイルス亜科に分類される.オルソコロナウイルス亜科は,さらに4つの属(genus),アルファコロナウイルス属,ベータコロナウイルス属,ガンマコロナウイルス属,デルタコロナウイルス属に分かれる.

コロナウイルスの基本的構造

SARS-CoV2-virus.jpg

オルソコロナウイルス亜科に分類されるウイルスの性状は以下の通りである.

粒子は100から120 nmの球形であり,細胞膜由来のエンベロープをもつ.コロナウイルスはスパイクタンパク質によるウイルス粒子表面の突起(長さは20 nm程度)が特徴的であり,電子顕微鏡写真ではその形状が王冠(コロナ)に似ているために,コロナウイルスと命名された.

脂質二重膜のエンベロープの中にNucleocapsid(N)蛋白に巻きついたプラス鎖の一本鎖RNAのゲノムがあり、エンベロープ表面にはSpike(S)蛋白、Envelope(E)蛋白、Membrane(M)蛋白が配置されている

ゲノムは直鎖状の一本鎖RNA(プラス鎖).ゲノムサイズは27kbから32kbで,RNAウイルスとしては現在知られている中で最大

5'末端にキャップ構造,3'末端にポリA配列,5′末端に約70bのリーダー配列,5'および3'末端に500 b以下の非翻訳領域(ポリAを含む)がある.

5'末端から約20 kbは非構造タンパク質の2個のオープンリーディングフレーム(ORF1aおよびORF1b)がある.ただし,ORF1aの末端付近でribosomal slippageが起きて−1のフレームシフトが生じ,1つのポリペプチドORF1abとなる.

その下流に,数個から10個以上の構造タンパク質をコードするORFがある.コロナウイルス亜科のウイルスが共通してもっている構造タンパク質は,ヌクレオカプシド(N)タンパク質,スパイク(S)タンパク質,インテグラルメンブレン(M)タンパク質,エンベロープ(E)タンパク質である.

Sタンパク質は感受性細胞膜上の受容体への結合および細胞侵入に関与する.

Mタンパク質とEタンパク質はウイルス粒子の集合および出芽に関与している.ベータコロナウイルス属では,血球凝集性エステラーゼ(HE)活性をもつHEタンパク質がある.ポリメラーゼやヘリカーゼなどの非構造タンパク質はORF1abから翻訳されるタンパク質が開裂することにより作られる.

コロナウイルスは,細胞表面に発現する受容体とSタンパク質が結合し,ウイルス膜と細胞質膜が融合して侵入する.
あるいは,エンドソームに輸送され,酸性環境下で細胞内プロテアーゼによりSタンパク質が構造変換し,エンドソーム膜と融合して,コロナウイルスは侵入する.

ウイルス粒子は細胞内小胞に出芽し,エクソサイトーシスにより,感染性ウイルスとして細胞外に放出される.

コロナウイルスの受容体

オルソコロナウイルス亜科のウイルスはさまざまな受容体を感染に利用しており,病態に関与している.

  • ブタ伝染性胃腸炎ウイルス,ヒトコロナウイルス229E,ネコ伝染性腹膜炎ウイルス,イヌコロナウイルスは,それぞれの動物のアミノペプチダーゼN(APN)分子を利用している.
  • ヒトコロナウイルスNL43とSARS-CoV-1,SARS-CoV-2はアンギオテンシン転換酵素2(ACE2)である
  • MERS-CoVは,ジペプチジルペプチダーゼ4(DPP-4)である.
  • 他にマウス肝炎ウイルスの受容体は癌胎児性抗原関連細胞接着分子1(CEACAM1),ウシコロナウイルスは9-O-アセチルシアル酸である.
  • SARS-CoV-2などのコロナウイルスはターゲットである細胞の表面にあるACE2分子と結合し侵入を開始する( ACE2を多数表面に出ているタイプの細胞であると、ウイルスが表面につきやすくなり、感染しやすい可能性などが考えられる.)
  • コロナウイルスのスパイクタンパク質(S)-ACE2 という結合が生じたのちに、II型膜貫通型セリンプロテアーゼ(TMPRSS2)という酵素などが作用し, スパイクタンパク質の一部を切断, 変形が起こり、その後, ウイルスエンベロープとターゲット細胞膜が融合するとウイルスは細胞内に侵入する. その後,ウイルス内容物(RNAゲノム+Nタンパク質)が細胞内へ侵入, 複製を開始させる.

一般的にコロナウイルスは宿主特異性が見られるが,イヌコロナウイルスはネコに感染する.また,SARS-CoV-1やSARS-CoV-2はともにイヌのACE2を比較的効率良く使用することができる*3

実験的には,SARS-CoV-1はネコやフェレットにも感染する*4

SARS-CoV-2のスパイクタンパク質とACE2の高次構造のコンピューター解析からも,SARS-CoV-2はさまざまな動物種に感染することが示唆されている*5

香港において,イヌがSARS-CoV-2にも持続感染することが国際獣疫事務局(OIE)に報告されており*6,ヒトに身近な家畜や伴侶動物がレゼルボア(感染巣)になることも危惧されている.身近な動物に感染したとしても,動物に病気を起こさず,ヒトにも伝達しなければ大きな問題にはならないので,その可能性の検証も早急に行う必要があると考えられる.

靴底を介したコロナウイルス伝播

ICUなどで働く医療者の靴底を介してコロナウイルスが播種する可能性がある: アメリカCDC
いまさらのことです. 動物伝染病がはやるときエリアへの出入りには靴底は消毒しますよね. 人間のコロナだって同じこと.

コロナウイルスの安定性, 感染力の持続について

多くの環境下でSARS-CoV-2は長時間安定し感染力を保持している. しかし, 家庭用の製品でも消毒法はかなり有効.
Chin AWH, et al. Stability of SARS-CoV-2 in different environmental conditions. The Lancet Microbe Available online 2 April 2020 correspondence to *7ScienceDirect より原著閲覧可能.

  • サージカルマスク:
    内側: 4日後まで(log TCID50は0分が5.88、4日後は2.47、7日後には陰性化)
    外側 7日後まで(log TCID50は0分が5.78、7日後は2.79)まで、感染価は当初の1000分の1程度ながら、感染力を持つウイルスが存在していた。
  • コピー用紙とティッシュペーパーの表面:
    30分後まで感染力を持つウイルスが検出されたが、3時間後には検出できなくなった。
  • 木材の表面と布の表面:
    3標本のうち1標本にのみ、1日後まで感染力を持つウイルスが検出されたが、2日目には全ての標本が陰性になっていた。
  • 紙幣表面:
    2日後まで感染性ウイルスが検出された. (4日後には陰性化)
  • ステンレス表面とプラスチック表面:
    4日後まで感染性のあるウイルスが検出できた。(7日後には陰性化)--72時間すればOKとする報告があるが要注意なデータですな.

    ウイルス感染価の判定-- 感染価を示すlog TCID50/mL
     
    ウイルス感染価:Virus Infectivity Titer
    細胞感染性を持つウイルス粒子の数. 測定対象とするウイルスに対して感受性を持つ細胞を用いて細胞感染性のウイルス量を測定する。
    ウイルス感染価の測定方法にはTCID50 法やプラック法等がある. いずれも ウイルス感染時に細胞が形態変化する性質を利用した測定法である。
     
    TCID50: Median tissue culture infectious dose
    予め細胞を培養して付着させた試験管やウェルプレート上にウイルス希釈液を接種し, 50%の細胞に対して感染する濃度のこと
  • 感染力が検出できなくなった標本(もの)を対象にPCR検査を行ったところ、多くが陽性になった。感染力がなくなっても、ウイルスRNAはしばらく溶液中に存在していた。
  • 気温と感染力の持続期間の関係
    ウイルスは、
    4度では高い安定性を示し、感染価は14日後までほとんど変化しなかった.
    22度では7日後まで、37度では24時間後まで感染力を維持していた.
    56度では30分後、70度では5分後には感染性のあるウイルスは検出できなくなった。
  • 消毒薬の検討

    室温22度での効果検討:log TCID50/mLが7.8のSARS-CoV-2液15μLに、通常使用する濃度の様々な消毒薬135μLを加えて5分後、15分後、30分後にウイルスの感染価を調べた。

    家庭用漂白剤50倍希釈、同100倍希釈、ハンドソープ液50倍希釈、消毒用エタノール70%、ポビドンヨード(7.5%)、クロロキシレノール(0.05%)、クロルヘキシジン(0.05%)、ベンザルコニウム塩化物液(0.1%)について検討
    ハンドソープ液の場合のみ、1検体で5分後に感染性のあるウイルスが存在していたが、それ以外の全てで、ウイルスは感染力を喪失した.

家庭用漂白剤(ハイターですね 次亜塩素酸です.)は皮膚や粘膜には絶対につかってはいけません. ハンドソープ, 石鹸, で充分です.

環境のpHとの関係; 室温22度で、pH3から10までの環境にウイルス液をおき、60分後に感染価を調べたところ、どのpH下でも感染価はほぼ同様で、低下は見られなかった。 

SARS-CoV-2は、ウイルスに適した環境下では安定性が非常に高い一方,標準的な消毒法はいずれも有効だった。

こまめな手洗いと消毒が絶対に必要である.

厚生労働省のN95マスク例外的再利用

厚労省は4月10日、滅菌器などを利用してN95マスクの再利用に努めるといった例外的取扱い方法の事務連絡を行っている.--->N95マスクの例外的取扱いについて
エアロゾルが発生するような手技(気管内吸引、気管内挿管、下気道検体採取など)を行う際にN95マスクの使用を推奨, それ以外の場面ではサージカルマスクなどを使用する.
その上で、本来使い捨てとされているN95マスクを再利用すること、有効期限にかかわらず利用すること、名前を記載して使用し交換は1日1回とすること.

N95マスクの再利用法:

  • ステラッド過酸化水素プラズマ滅菌器を用いた方法を用いた方法--米国ASP社が米国食品医薬品局(FDA)、米国疾病予防管理センター(CDC)とともに作成したインストラクションを参考
    この方法で再利用を続けた場合、3回で換気能が低下するため、再利用は2回を限度とする。

  • ウイルスが自然に死滅するのを待つ方法
    新型コロナウイルスがプラスチック、ステンレス、紙の上では72時間しか生存できないとの報告を受けての方法. 1人に5枚のN95マスクを配布し、5日間のサイクルで毎日取り替えながら、清潔に保管して繰り返し使用することを提案している。

後者についてはコロナウイルスの長期安定性にかんがみ, より慎重をきすべきと考える.

Covid-19 エアロゾルによる感染

エアロゾルはdropletと異なり, 長期に空気中に漂い, 肺胞に達する能力をもつ. 感染可能環境では適切なマスク使用が必要であるし閉鎖空間の適切な換気が必要である. New Engl J Med. 15 Apr 2020.

うがいや歯磨きのときも気をつけましょう. 食品を扱う流しでうがい歯磨きはマナー違反です. 手洗い/洗面所を利用し, ヒトのいる場所はさけましょう. 仕事場では要注意.

 

新型コロナウイルスの感染が疑われる人がいる場合の家庭内での注意事項: 浜松市

Web siteを見る-->新型コロナウイルスの感染が疑われる人がいる場合の家庭内での注意事項

1. 感染者と他の同居者の部屋を可能な限り分ける
2. 感染者の世話をする人は、できるだけ限られた方(一人が望ましい)にする
3. できるだけ全員がマスクを使用する
4. 小まめにうがい・手洗いをする
5. 日中はできるだけ換気をする
6. 取っ手、ノブなどの共用する部分を消毒する
7. 汚れたリネン、衣服を洗濯する--患者さんの衣服は別に洗濯し, 触れたところは消毒する.
8. ゴミは密閉して捨てる-外は消毒する.

いってることはわかるけど, 実際狭い家で隔離はなかなか困難です.

一番大事なのはコロナにかからないこと. 人との接触をさけ, あぶないところには近づかない. これが不可能な, 医療従事者はさらに必要な感染対策を実行する必要があります.

 
 

BCGとコロナ重症化の関係

これは学問として大変興味深いこと[Giovanni Sala, Tsuyoshi Miyakawa Association of BCG vaccination policy with prevalence and mortality of COVID-19]*8 ですが, 今すぐにコロナ対策として間に合うわけでも, 確実な結論がでているわけでもありません.WHOはBCGの接種を推奨しない*9と明示しています.
BCG*10を今から接種したってコロナの予防や重症化を防ぐことはできんのです.

ましてや, BCGを皮下注するなどとんでもない!! 皮膚に薬液を塗って, 針のはんこで圧迫する皮内接種法です. 皮下注なんかしたら潰瘍化など強い局所反応がおこります. 全身に過剰免疫反応がでる可能性もあります. BCGのもともともの副反応はリンパ節腫大や, 大変まれですが骨髄炎などです.

Shimura-ken.jpg

BCGの歴史*11

1944年(昭和19年)農村から都市部へ出ようとする青少年、工場などの集団生活においてツベルクリン反応で陰性の者はBCG接種の対象となる。
1949年(昭和24年)BCGによる結核予防接種が法制化。30歳未満の人に毎年ツベルクリン反応検査を行い、BCGによる免疫が確認されなかった場合は繰り返し接種を行う.
1951年(昭和26年)より近代的な「結核予防法」が施行され, 小学校就学前の乳幼児を対象に、毎年ツベルクリン反応陽性以外ならBCG接種(皮内)がおこなわれた.
1967年(昭和42年より皮内接種法から管針を用いて行う現在の経皮接種法に変更されている.
1974年(昭和49年)には乳幼児(4歳未満), 小学校1年生、中学校2年生の3回にBCG接種が定期化された.
2005年(平成17年)接種対象者が生後6ヵ月までに変更され、事前のツベルクリン反応検査を省略する直接接種となる. 2007年(平成19年)結核予防法が感染症法に併合される.
2013年(平成25年), 接種対象者が今の生後1歳に達するまでに変更され現在に至っている.

1949年に30歳以上の人はBCG接種を受けていない方もおられるわけですが. 2020年においてこれらの方々は101歳以上というご高齢です. ツベルクリン反応陽性の方はBCG注射はうけていません. wikipatho管理人は偽陽性でBCGを皮内注射され肩が腫れ, 瘢痕ができてしまいました.

今年54歳以上の人で自分がBCGをうったかどうか知りたい方は, 左上腕, 肩のあたりに瘢痕がないかどうか確かめましょう. 腕に痕を残す予防接種といえば種痘とBCGです. 種痘は原則 右上腕伸側, 右肩部. BCGは左上腕, 左肩に接種されます.*12
[60歳までの方には(1974年に中学2年生の人)下記の点々が残っている場合もあります]

54歳未満の方はいわゆるはんこ注射になり跡が点々になっています. 最近は生後1歳までに接種されるため瘢痕がわかりにくい. 自分の子たち(30歳代)には跡がありますが, 孫たち(6-8歳)には跡はなくなっています.

2020年3月,新型コロナ感染症で亡くなったコメディアン志村けんさんは享年70歳. 1951年の生まれです. 志村けんバカ殿様の1シーンに腰元をしかりつけるバカ殿が「この腕のBCGの跡が目に入らぬか」というセリフがあり左上腕を指さしていました(右写真).
志村さんは年齢からも, BCG接種をしっかりうけていたようですね. BCGを接種したからコロナで死なないとは限らないのです. BCGを接種しないとコロナで死んでしまうというのは妄想です. ましてや今からBCGをうっても対コロナ対策にはなりません. 合掌.

新型コロナウイルス感染症(COVID-19)に対するBCGワクチンの効果に関する見解*13

「新型コロナウイルスによる感染症に対して BCG ワクチンが有効ではないか」という仮説は、いまだその真偽が科学的に確認されたものではなく、現時点では否定も肯定も、もちろん推奨もされない。

BCG ワクチン接種の効能・効果は「結核予防」であり、新型コロナウイルス感染症の発症および重症化の予防を目的とはしていない。また、主たる対象は乳幼児であり、高齢者への接種に関わる知見は十分とは言えない。

本来の適応と対象に合致しない接種が増大する結果、定期接種としての乳児へのBCG ワクチンの安定供給が影響を受ける事態は避けなければならない。

小児と新型コロナウイルス感染症

国立国際医療研究センター 国際感染症センター 忽那賢志Drの記事 感染症専門医

[[小児と新型コロナ 重症化しないから安心ってホント?:https://news.yahoo.co.jp/byline/kutsunasatoshi/20200419-00173752/ ]]

  • 小児では感染しないわけではなく、感染しても軽症で済むために大半の症例が見逃されている
  • 小児は大半が軽症例で, 重症化は少ない.
  • 成人に比べて小児は症状が乏しい. 新型コロナウイルス感染症は、軽症であれば風邪と区別がつかない.
  • 重症化しないわけではない 特に乳幼児や持病のあるお子さんは注意
  • 特に1歳未満の乳幼児では、重症と最重症を足した割合が1割を超えています。10代であっても16人に1人は重症または最重症になる. 子どもであっても絶対に「感染しない方が良い」
  • 持病のあるお子さんは特に注意が必要です。
    アメリカで新型コロナと診断された小児345症例のうち、80例(23%)には少なくとも1つの持病があった.
    最も頻度が高いのは慢性肺疾患(喘息を含む)(40人)、心血管疾患(25人)、および免疫抑制状態(10人)
    重症度が判明した295人小児例のうち、ICUに入室した6人の患者全員を含む37人中28人(77%)の入院患者は、1つ以上の持病を抱えていたとのことです。
    入院していない258人の患者のうち、持病を持っていたのは30人(12%)だった--やはり小児でも持病があると重症化しやすい
     
  • アメリカでは小児の90%が家庭内または市中で感染している*14
    日本でも大人が持ち帰った新型コロナウイルスが家庭内で伝播し、子ども同士が遊ぶことで感染が広がる可能性がある.
    子どもは重症化のリスクが少ないとしても、周囲に感染を広げないためにはやるべきことは大人と同じ
    ・外出を控える
    ・こまめに手を洗う
    ・人との距離を保つ(2M以上)
    ・よく触る環境表面をこまめに消毒する

*1  宮沢孝幸, 中川 草 新型コロナウイルスSARS-CoV-2の比較ウイルス学と比較ゲノム解析 2020年5月号 実験医学online:羊土社 - 羊土社 (登録してログインで全文にアクセスできます)
*2  Gorbalenya AE, et al:Nat Microbiol, doi: 10.1038/s41564-020-0695-z(2020)
*3  Hoffmann M, et al:Cell, doi: 10.1016/j.cell.2020.02. 052(2020)
*4  Martina BE, et al:Nature, 425:915, 2003.
*5  Wan Y, et al:J Virol, doi:10.1128/JVI.00127-20(2020)
*6  World Organisation for Animal Health. https://www.oie.int/about-us/(Date Reported: 29 February 2020)
*8  https://doi.org/10.1101/2020.03.30.20048165
*9  https://www.who.int/news-room/commentaries/detail/bacille-calmette-gu%C3%A9rin-(bcg)-vaccination-and-covid-19
*10  https://jata.or.jp/rit/rj/332P15-16.pdf
*11  wikipedia:https://ja.wikipedia.org/wiki/BCG
*12  まきの内科クリニックweb page. 腕の傷痕で年齢がわかる〜予防接種に歴史ありより
*13  新型コロナウイルス感染症(COVID-19)に対する BCG ワクチンの効果に関する見解(日本ワクチン学会)http://www.jsvac.jp/pdfs/kenkai.pdf
*14  CDC COVID-19 Response Team. Coronavirus Disease 2019 in Children - United States, February 12-April 2, 2020. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2020 Apr 10;69(14):422-426. doi: 10.15585/mmwr.mm6914e4.

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Last-modified: 2020-05-11 (月) 06:55:25 (169d)